La famiglia Balbi era profondamente religiosa. Contribuì grandi somme di denaro alla chiesa e numerosi membri della famiglia scelsero la vita religiosa in convento o nel sacerdozio, Alcuni raggiunsero i più alti livelli della Chiesa Cattolica, incluso quello di cardinale. Uno dei più grandi contributi della famiglia Balbi fu la fondazione del Collegio Gesuita a Genova (a sinistra) che attualmente fa parte dell'Università di Genova, situata in via Balbi.
La fondazione del Collegio Gesuita costituì un processo lungo e difficile per la famiglia Balbi. Nel 1621, fu ottenuta la licenza per costruire il Collegio. I Balbi produssero i mezzi finanziari per avviare questo progetto costoso. Durante la costruzione, la famiglia Balbi mise a disposizione altri edifici usati dai gesuiti quali aule scolastiche. La costruzione del Collegio cominciò nel 1636 e fu completata nel 1643.
Stefano Balbi fu il personaggio principale coinvolto con la costruzione del Collegio Gesuit a e fu assistito da suo cugino Gio Francesco II. Stefano era molto ammirato dai gesuiti e venne riconosciuto per l'immenso lavoro svolto. La costruzione del Collegio richiese molte autorizzazioni governative. Ci fu bisogno addirittura del permesso del Vaticano. Il Senato genovese assegnò al gesuita Paolo Balbi, la responsabilità di governare il Collegio.
Giovan Battista Balbi con il cugino Francesco Maria Balbi furono responsabili per la creazione del cortile del collegio, dove lo stemma dei Balbi fu applicato alle pareti. Francesco Maria Balbi fu anche grandemente coinvolto nella costruzione della chiesa di San Francesco Saverio situata dentro il Collegio Gesuita. In seguito, egli fu sepolto in quella stessa chiesa. Oggi in questo luogo c'è una lapide dedicata a Francesco Maria e alla famiglia Balbi.
Nicolo Balbi I e il suo primogenito, Gio Francesco I furono sepolti nella chiesa dell'Annunciata, situata in Via Balbi a Genova. Giacomo Balbi I, figlio di Pantaleone I fu sepolto nella tomba di famiglia nella chiesa dell'Annunciata Vestaso. Pantaleone II fu sepolto nella chiesa dell'Annunciata di Castelletto. Stefano Balbi fu sepolto a Genova, nella chiesa di San Pietro a Porta Nuova.